С сентября 1886 г. г. Г. А. Пахульский поступил преподавателем по классу фортепиано; Н. М. Ладухин – по классу теории музыки. Оставил занятия по консерватории Г. А. Ларош.

Чтение лекций по истории литературы взял на себя С. А. Юрьев.

15 февраля состоялся в большой зале Благородного собрания концерт учащихся под управлением С. И. Танеева. В качестве солистов приняли участие – у-цы: Е. Магицкая, С. Малкиель, Н. Миланова, В. Миллер, М. Пинья, В. Ремезова, А. Скомпская, и у-ки: Ф. Бобров, Н. Соколовский, Г. Чабан и Д. Шор. Девятью учениками скрипичного класса И. В. Гржимали была исполнена в унисон «Чакона» И. С. Баха. Оркестром, хором и солистами из учащихся были сверх того исполнены четыре номера из мессы F-dur Моцарта. Хором и солистами из учащихся с аккомпанементом приглашенного оркестра были исполнены четыре номера из оперы П. Чайковского «Чародейка», тогда только что оконченной.

В зале консерватории в марте 1887 г. была исполнена несколько раз под управлением С. И. Танеева оратория Генделя «Израиль в Египте» с исключительным участием учащихся в консерватории.

В конце года выбыли из состава профессоров консерватории: Дж. Гальвани, М. М. Милорадович и Э. К. Медер. Дж. Гальвани должен был оставить занятия по расстроенному здоровью; он пробыл в консерватории 18 лет и подготовил многих деятелей для оперной сцены.

В мае 1887 окончили курс с дипломами: А. Линберг, Е. Магницкая, А. Страхова и С. Бартенев; с аттестатами по педагогическому отделению фортепиано: Е. Гнесина, Е. Дмитриева и А. Ульрих. Из них удостоены медалей: малой золотой –  Е. Магницкая, большой серебряной –  А. Страхова и малой серебряной –  Е. Гнесина.

Вместо выбывшего Э. К. Медера, с сентября 1887 г. профессором по классу гобоя приглашен артист Императорских театров В. Ф. Линднер. Возвратившийся из разрешенного ему отпуска А. С. Аренский возобновил свои занятия в консерватории. С января 1888 г. Е. А. Лавровская поступила профессором по классу пения.

Из состава преподавателей научных предметов выбыли М. М. Панов, Е. В. Кирхнер и С. А. Юрьев. Вновь поступили: И. Л. Банг –  преподавательницей немецкого языка, В. Ф. Воронова –  преподавательницей французского языка. Вместо С. А. Юрьева чтение лекций всеобщей литературы поручено А. Е. Грузинскому.

1887 г. исполнилось столетие со дня первой постановки «Дон Жуана» Моцарта; в память этого события на сцене в консерватории был поставлен 1-й акт «Дон Жуана». Исполнителями партий соло, хора и оркестра были исключительно учащиеся в консерватории. Спектакль был дан 6 декабря и повторен 9-го того же месяца. Роли были распределены нижеследующим образом: Дон-Жуан –  Ф. Бобров, Донна Анна – А. Скомпская, Дон Оттавио –  М. Шнейдер, Командор –  С. Борисоглебский, Донна Эльвира –  Н. Миланова, Лепорелло –  А. Брехов, Мазетто –  С. Борисоглебский, Церлина –  М. Эйхенвальд. Дирижировал С. И. Танеев.

8 апреля 1888 в Малом театре учащимися в консерватории под управлением С. И.  Танеева была исполнена опера в 4-х действиях и 5-ти картинах Моцарта «Свадьба Фигаро»; перевод либретто П. И. Чайковского. Партии распределены были нижеследующим образом: Граф Альмавива –  Ф. Бобров, Графиня – Н. Миланова, Фигаро – А. Брехов, Сусанна – А. Скомпская, Дон Бартоло – С. Трезинский, Марселлина – В. Ремезова, Керубино – М. Эйхенвальд, Дон Курцио – П. Иноземцев, Барбарина – А. Крапоткина, Антонио – С. Борисоглевский.

18 февраля 1888 г. состоялся в большой зале Собрания концерт учащихся под управлением С. И. Танеева. В качестве солистов приняли участие уч-цы: Т. Гинкулова, В. Миллер, В. Ремезова, А. Скомпская, у-ки: Ф. Бобров, В. Вильшау, Л. Конюс, Ю. Конюс, Д. Крейн, И. Левин, М. Семашко, С. Трезинский и Д. Шор. Хором учащихся исполнены были два отрывка из оратории Генделя «Торжество звуков» и заключительный хор их оперы А. С. Аренского «Сон на Волге». Сверх того была исполнена баллада для оркестра у-ка Г. Конюса.

В мае 1888 г. окончили курс с дипломами: С. Богомолова, М. Мальковская, В. Миллер, Е. Немыцкая, Е. Никитина, И. Зверев, Л. Кипп, Ю. Конюс, С. Рязанцев, Н. Соколовский, И. Соханский; окончили курс с аттестатами по педагогическому отделению: А. Андреева и Е. Блюм. Аттестаты по специальностям получили А. Скомпская (по классу пения) и Д. Крейн (по классу скрипки).

Награждены медалями: малой золотой – В. Миллер и Ю. Конюс, большой серебряной – Н. Соколовский, малой серебряной – С. Богомолова, А. Скомпская, Д. Крейн и С. Рязанцев.

А. Ю. Скомпская была командирована для усовершенствования за границу на суммы из процентов с капитала А. А. Задонской.